第三方保稅物流管理信息系統(tǒng)能夠滿足海關(guān)對保稅物品進(jìn)、出、存、退、換和完稅的管理需求，滿足不同貨主對其保稅備件倉儲、保管、包裝、配送、退貨和回收的相異的物流管理要求；能夠適應(yīng)多組織架構(gòu)物流公司的管理和多倉庫統(tǒng)一管理的要求；能夠滿足多貨主的不同備件保稅或完稅物流管理的需求；能夠滿足貨主業(yè)務(wù)發(fā)展的需要，進(jìn)行不同區(qū)域的快速配送服務(wù)；能夠快速調(diào)整和適應(yīng)因貨主備件物流管理過程的變化要求；能夠?qū)f(xié)作的承運商進(jìn)行管理，包括費用的按期結(jié)算；能夠設(shè)定各種物流費用（包括各種關(guān)稅和海關(guān)代收），系統(tǒng)按業(yè)務(wù)量自動結(jié)算物流費用和各種稅收，也可手工調(diào)整和補(bǔ)錄費用；貨主隨時可以查詢訂單執(zhí)行情況、庫存和物流費用結(jié)算情況等；海關(guān)隨時掌控保稅區(qū)保稅備件的進(jìn)、出、存、退、換和完稅情況；系統(tǒng)支持倉庫使用RF和條碼設(shè)備，對倉庫的庫位、備件實現(xiàn)條碼管理，在倉庫中使用RF進(jìn)行在線作業(yè)，提率、降低出錯率、降低物流成本；有數(shù)據(jù)接口，將不同貨主的訂單自動導(dǎo)入物流系統(tǒng)；對備件的價格、批號、序列號等管理；對備件可實現(xiàn)全程跟蹤查詢；按貨主要求的報表格式產(chǎn)生貨主索要的各類報表；未來能順利拓展相關(guān)功能，實現(xiàn)報關(guān)管理、貨代管理和運輸管理等，并且是一體化的初始數(shù)據(jù)在各模塊享；提供各類分析報表，給管理提供數(shù)據(jù)的依據(jù)，不斷改進(jìn)管理，提高服務(wù)質(zhì)量，提高客戶滿意度。

保稅區(qū)儲區(qū)別于一般倉儲之處在于保稅區(qū)儲的力度要大得多。

保稅區(qū)儲是指使用海關(guān)核準(zhǔn)的保稅區(qū)庫存放保稅貨物的倉儲行為。保稅貨物主要是暫時進(jìn)境后還需要復(fù)運出境的貨物，或者海關(guān)批準(zhǔn)暫緩納稅的進(jìn)口貨物。保稅區(qū)儲受到海關(guān)的直接，雖然說貨物也是由存貨人委托保管，但保管人要對海關(guān)負(fù)責(zé)，入庫或者出庫單據(jù)均需要由海關(guān)簽署。保稅區(qū)儲一般在進(jìn)出境口岸附近進(jìn)行。
第三方物流自主管理的保稅區(qū)儲業(yè)務(wù)，是近幾年新推出的保稅物流業(yè)務(wù)，是依據(jù)的保稅貨物進(jìn)出口報關(guān)和完稅的新型管理模式。在這種新型管理模式下，保稅區(qū)可以設(shè)在保稅區(qū)外，海關(guān)下放部分操作程序，由第三方物流企業(yè)自主管理，海關(guān)可以隨時查看保稅區(qū)的庫存情況，對保稅區(qū)實行。
保稅區(qū)每月向海關(guān)申報一次貨物進(jìn)出口清單，并與海關(guān)系統(tǒng)核對保稅貨物的庫存，一次完稅，大大簡化了進(jìn)出關(guān)的手續(xù)，加快了通關(guān)速度。此種管理模式特別適用于對時間和庫存要求比較高的維修備件的保稅庫存業(yè)務(wù)。

自主管理的保稅區(qū)儲物流企業(yè)，必須通過海關(guān)的嚴(yán)格審核才能營運。
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