貨物在倉庫中的全周期需要能夠實時掌握，因此保稅區儲的管理信息系統要求也高很多。

庫存信息化通過庫存物品的入庫、出庫、移動和盤點等操作對企業的物流進行全面的控制和管理，能夠降低庫存，減少資金占用，杜絕物料積壓與短缺現象，提高服務水平，保證生產經營活動的順利進行。

保稅區庫應當按照海關批準的存放貨物范圍和商品種類開展保稅區儲業務。
1．保稅區儲貨物進倉
（1）經海關批準，下列貨物可以存入保稅區庫：
a．加工貿易進口貨物；
b．轉口貨物；
c．供應國際航行船舶和的油料、物料和維修用零部件；
d．供維修外國產品所進口寄售的零配件；
e．外商暫存貨物；
f．未辦結海關手續的一般貿易貨物；
g．經海關批準的其他未辦結海關手續的貨物。
（2）有下列情況的貨物不得存入保稅區庫：
a．海關規定不得存入保稅區庫的貨物，如汽車、辦公用品、家用電器等；
b．按規定須提供許可而企業不能提供的貨物，如易化學品、軍民用化學品、廢舊物資等；
c．申報進倉貨物超經營范圍的；
d．申報進倉貨物超倉儲能力的；
e．申報進口備料倉庫的保稅貨物超企業年加工生產能力。

保稅區儲受到海關的直接，雖然說貨物也是由存貨人委托保管，但保管人要對海關負責，入庫或者出庫單據均需要由海關簽署。保稅區儲一般在進出境口岸附近進行。
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