深圳坪山綜合保稅區地處深圳東部，臨近鹽田港與深港東部邊界的蓮塘/香園圍口岸，在深港跨境交通“東進東出、西進西出”格局下，區位比較優勢突出，出入境交利快捷。經坪鹽通道25分鐘可抵達鹽田港，東部過境高速30分鐘可抵達蓮塘/香園圍口岸，南坪快速、沈海高速50分鐘可抵達皇崗口岸，60分鐘可抵達深圳寶安國際機場，90分鐘可抵達中國香港國際機場。此外，坪山高鐵站可直達中國香港，14、16號線正在加速建設。
功能定位：綜合保稅區和自貿區一樣，是我國目前開放層次、優惠政策多、功能齊全、手續簡化的開放區域，綜合保稅區是海關區域的形態。海關參照有關規定對綜合保稅區進行管理，執行保稅港區的稅收和外匯政策，集保稅區、出口加工區、保稅物流區、港口的功能于一身，可以發展國際中轉、配送、采購、轉口貿易和出口加工等業務。根據現行有關政策，海關對綜合保稅區實行封閉管理，貨物進入綜保區，實行保稅管理；境內其他地區貨物進入綜保區，視同出境。
模式 出口方(A) 進口方(B) 舉例說明
1 加貿企業
(手冊報關) 加貿企業
(手冊報關) AB皆為進料加工企業；A生產的成品正好是B需要進口的原材料，A通過將貨物出口到坪山出口加工區以便實現出口退稅，然后由B再申報進口，此操作讓AB企業都可以核銷手冊。
2 一般貿易企業
(一般貿易報關) 加貿企業
(手冊報關)
A為一般貿易企業，B為進料加工企業；A生產的成品正好是B需要進口的原材料，（備注：B所需原材料不允許在國內直接采購，需要進口才能核銷手冊）故A通過將貨物出口到坪山出口加工區以便實現出口退稅，然后由B再申報進口，B可憑進口報關單核銷其手冊。
3 加貿企業
(手冊報關) 一般貿易企業
(一般貿易報關) A為進料加工企業，B為一般貿易企業；A生產的成品正好是B需要的原材料，（備注：A生產的成品需要出口，以實現出口核銷，如直接在國內銷售將被要求補征原材料進口稅）故A通過將貨物出口到坪山出口加工區以完成出口，實現手冊出口核銷，B可根據生產情況定時分批征稅報關進口該原材料。

加工貿易企業—-加工貿易企業
加工貿易企業E將保稅進口料件加工的產品轉至另一加工貿易企業F進一步加工復出口，它是海關備案手冊之間的結轉，要求轉出、轉入企業雙方都是加工貿易企業。
解決方案
傳統轉廠：（深加工結轉）雙方先需要在各自的主管海關計劃備案，其次按照經雙方海關核準后的申請表進行實際收發貨，轉出、轉入企業分別在轉出地、轉入地海關辦理結轉報關手續。
保稅區報關：轉出、轉入企業不需要先計劃備案，發貨和報關同時進行，當日便可完成轉廠手續；只需提前提供資料審核，轉出企業裝好貨上午過來深圳坪山綜合保稅區報關，上午能完成報關手續，下午貨物已經到達轉入企業。

1、一般貿易企業轉廠給國內外資企業
國內A企業是一般貿易企業，是液晶顯示器生產廠家，國內外資企業B是進料加工企業，是液晶電視機生產廠家。A工廠的產品正好是B工廠的原材料。但是B工廠的原材料不可以在國內直接購買，需要進口才能核銷手冊，所以B工廠要求A工廠做轉廠交貨。即A工廠先把貨物出口到再由B工廠用手冊申報進口。
解決方案：
深圳坪山綜合保稅區具有“境內關外”的性質，貨物出到深圳坪山綜合保稅區相當于貨物出到一樣，所以A工廠實際只需要把貨物出到深圳出口加工區申報出口，B工廠申報進口。
A工廠出口可以申請退稅，取得價格上的優勢，B工廠也可以核銷其手冊。

4 一般貿易企業
(一般貿易報關) 一般貿易企業
(一般貿易報關) 備注：這類業務情況相對以上三種很少出現。
所需資料：
1.裝箱清單
2.
3.一般貿易企業提供購銷合同/加工貿易手冊企業提供手冊表頭表體
4.報關單草單（需體現：收發貨人、消費使用單位、收發貨人、HS編碼、品名、單位、數量、單價、總價、總重量、貿易國別、境內貨源地）
5.司機資料（司機聯系方式、信息、車型、空車重量），車輛要求普通箱式貨車即可，無需備案車輛                                                 注：1-5資料我司可以提供資料格式
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